Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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