Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms