Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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