Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms