Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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