Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms