Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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