Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pin4Q9CWW6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms