Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms