Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdca4Q9CWM2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdca4Q9CWM2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms