Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9CRC3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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