Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms