Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CPS8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CPS8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CPS8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CPS8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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