Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH2

Pard3, Partitioning defective 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3Q99NH2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3Q99NH2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms