Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms