Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms