Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms