Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms