Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp5lQ99LH9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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