Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gps1Q99LD4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gps1Q99LD4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms