Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1aQ99L02 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms