Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hps4Q99KG7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hps4Q99KG7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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