Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pacsin3Q99JB8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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