Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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