Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctu1Q99J10 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms