Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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