Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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