Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms