Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms