Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM5

Myocd, Myocardin, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyocdQ8VIM5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyocdQ8VIM5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyocdQ8VIM5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyocdQ8VIM5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyocdQ8VIM5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyocdQ8VIM5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyocdQ8VIM5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyocdQ8VIM5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyocdQ8VIM5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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