Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39cQ8VE09 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms