Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Slc6a20aQ8VDB9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Slc6a20aQ8VDB9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Slc6a20aQ8VDB9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Slc6a20aQ8VDB9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc6a20aQ8VDB9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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