Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Top1mtQ8R4U6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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