Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms