Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssh3Q8K330 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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