Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms