Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit1Q8K099 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms