Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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