Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ercc8Q8CFD5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ercc8Q8CFD5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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