Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms