Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms