Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms