Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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