Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms