Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdcl3Q8BVF2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdcl3Q8BVF2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms