Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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