Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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