Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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