Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NfascQ810U3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfascQ810U3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms