Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ube2q1Q7TSS2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms